В структуру ФКУ "ЦСА ОПС" МВД России вошли: отдел сертификации и лаборатория испытаний, состоящая из отдела исследовательских испытаний и экспертизы технических средств охраны и охранно-пожарной сигнализации, отдела испытаний технических средств охраны на электромагнитную совместимость, а также вспомогательные подразделения: группа кадров, финансово-экономическое отделение, отделение развития и обеспечения и канцелярия.

В настоящее время ФКУ "ЦСА ОПС" МВД России аккредитовано Федеральным агентством по техническому регулированию и метрологии Министерства промышленности и энергетики Российской Федерации (Ростехрегулирование) в Системе сертификации электрооборудования и электрической энергии ГОСТ Р, а также Управлением государственного пожарного надзора Министерства Российской Федерации по делам гражданской обороны, чрезвычайным ситуациям и ликвидации последствий стихийных бедствий (УГПН МЧС России - в настоящее время ДНД МЧС России) в Системе сертификации в области пожарной безопасности в Российской Федерации в качестве Органа по сертификации и независимой, технически компетентной Лаборатории испытаний.